Vocabulario inglés-español de bioquímica y biología molecular (7.a entrega)

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Conforme la biología molecular y sus ramas conexas van arrojando luz sobre fenómenos apenas conocidos, crecen en número los tecnicismos y neologismos que se acuñan en inglés y divulgan en revistas y textos de biología. El proceso de concepción y fijación de términos de biología molecular en ese idioma sigue habitualmente un ritmo muy superior al de su traducción y divulgación en español, y no es raro que circulen en nuestra lengua diversas denominaciones de un mismo concepto, tanto en los textos especializados como en Internet, sin que el lector atine a saber a ciencia cierta si todas son igualmente válidas y aplicables, incluso siendo experto en la materia. A lo anterior se suma el hecho de que muchos de los términos o expresiones circulantes son más fruto de la traducción literal a la ligera que de la traducción meditada por parte de traductores y profesionales del ramo. Apenas existen glosarios o diccionarios bilingües inglés-español de autores hispanohablantes que proporcionen no solamente soluciones traductoriles válidas, sino también orientación crítica al especialista en la toma de decisiones terminológicas, mediante la inclusión de observaciones, información complementaria y contextos de uso procedentes de fuentes fiables de consulta, además de la respectiva bibliografía. Este vocabulario de bioquímica y biología molecular, que se publica por entregas e inevitablemente incluye términos o expresiones de otras disciplinas emergentes o estrechamente emparentadas con lo molecular (genética, genómica, bioinformática, biología de sistemas, etc.), pretende colmar algunas de estas lagunas y contribuir a que los profesores y estudiantes de biología, así como los traductores, editores, correctores de estilo y divulgadores científicos de habla hispana podamos comunicarnos con tanta claridad y corrección como sea posible en nuestro propio idioma.
Publicado el : sábado, 01 de enero de 2005
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Fuente : Panace@. Boletín de Medicina y Traducción 1537-1964 2005 Volumen 6 Número 21-22
Número de páginas: 11
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<www.medtrad.org/panacea.html> Traducción y terminología
Vocabulario inglés-español de bioquímica y biología
amolecular (7. entrega)
*María Verónica Saladrigas
amorph: alelo amorfo, alelo nulo. bioinformatics?» Nicholas M. Luscombe define los
prin→ null mutation cipales objetivos de esta disciplina del modo siguiente: 1)
amorphic mutation: mutación amórfica, mutación anuladora. organizar los datos biológicos de forma que los investiga-
→ null mutation dores tengan acceso a la información existente y puedan
array: matriz. a su vez enviar información a medida que obtienen
daDistribución ordenada de moléculas o de muestras bio- tos experimentales nuevos (p. ej.: bancos de datos sobre
lógicas sobre un soporte sólido. estructuras tridimensionales de proteínas, como el Protein
Observación: según la naturaleza de las moléculas Data Bank); 2) crear las herramientas y los recursos
neceo las muestras biológicas inmovilizadas sobre el soporte sarios para efectuar análisis específicos (p. ej.: programas,
en cuestión, destacan distintos tipos (p. ej.: DNA arrays, como FASTA y PSI-BLAST, que permiten comparar las
protein arrays, tissue arrays). Por lo general, si la matriz secuencias de aminoácidos de proteínas desconocidas con
admite miniaturización o contiene una gran densidad de las de de ya
caracterizamuestras de tamaño muy pequeño, se antepone el prefi- das); 3) utilizar dichas herramientas para analizar los datos
jo micro- (microarray, micromatriz), y si no la admite o de forma global e interpretar los resultados a fin de extraer
contiene un menor número de muestras de tamaño mayor, su significado biológico (p. ej.: análisis global de un
sisse antepone el prefijo macro- (macroarray, macromatriz). tema biológico en particular y su comparación con otros
Otras veces, el prefijo micro- se coloca de forma arbitraria sistemas relacionados a efectos de revelar los principios
para destacar el tamaño relativamente pequeño del sopor- comunes por los que se rigen y poner de manifiesto
propte, sin que se haya establecido a partir de qué tamaño se iedades propias de alguno de ellos o nuevas).
debe hablar ya de micromatriz. Sin más especificación, Observación: varias fuentes coinciden en que el
la mayoría de las veces es una micromatriz (microarray). término bioinformatics se concibió, a mediados de 1980,
En México y la Argentina se traduce generalmente por para referirse únicamente al análisis de datos procedentes
«microarreglo» o «microordenamiento» (microarray). Es de secuenciaciones biológicas (la fecha de su entrada en
sinónimo de biochip o chip (en su primera acepción). circulación se puede constatar mediante una búsqueda en
biochip: biochip. la base de datos HighWire Press, de la Universidad de
1 Matriz. Véanse array y DNA array. Stanford). En la actualidad, como acabamos de ver, su
2 Circuito integrado (chip) cuyas funciones lógicas y elec- significado es un poco más amplio, aunque hasta hoy
totrónicas son realizadas por moléculas de proteína manipu- davía no existe una definición consensuada. Por una parte,
ladas convenientemente. según John M. Hancock (Dictionary of bioinformatics
Observación: a mediados de 1980 esta palabra se and computational biology, 2004), los términos
bioinutilizaba sobre todo en su segunda acepción, aunque por formatics y computational biology pueden considerarse
entonces también tenía el significado médico de micro- sinónimos; el primero es más frecuente en el Reino Unido
chip implantable («implantable solid-state devices used as y Europa, y el segundo, más utilizado en los EE. UU.
neurological or physiological prostheses»). Desde finales Por otra, también según Hancock, algunos atribuyen a la
de 1990 hasta la actualidad, en el ámbito de la biología bioinformática un significado un poco más restringuido:
molecular se utiliza casi siempre como sinónimo de array «[bioinformatics can be considered] the computational
(matriz). Sin otro calificativo normalmente se refiere a una storage and manipulation (but not analysis) of
biologimicromatriz de ADN. cal information and computational biology as a more
biobioinformaticist: bioinformático. logy-oriented discipline aimed at learning new knowledge
Persona con los conocimientos necesarios de biología e about biological systems». Incluso cuando se establece
alinformática para comprender un problema de índole medi- guna diferencia entre ambas, los límites son muy difusos,
cobiológica y luego diseñar, someter a prueba y poner en y no hay concordancia estricta entre las definiciones que
marcha estrategias basadas en técnicas informáticas para se ofrecen; véanse, por ejemplo, las que recogen Benfey y
resolverlo. Véase bioinformatics. Protopapas en su libro Essentials of Genomics:
«computabioinformatics: bioinformática. tional biology is a term to describe the development of
alInformática aplicada a la recolección, al almacenamiento gorithms to solve problems in biology. [...] Bioinformatics
y al análisis de datos biológicos. En su artículo «What is is the application of computational biology to real data for
* Doctora en Ciencias Biológicas, con especialización en Biología Molecular, por la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de
Buenos Aires (Argentina). Traductora y revisora. Novartis Pharma AG, Basilea (Suiza). Dirección para correspondencia: mariaveronica@freesurf.ch.
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the purposes of analysis and data management.», o el ca- informática; la otra es el análisis basado en simulaciones
tedrático David M. Glick en su Glossary of Biochemistry (simulation-based analysis).
and Molecular Biology: «[Bioinformatics is t]he manage- En castellano, se halla muy difundido en la práctica
ment, manipulation and use of DNA nucleotide sequenc- el calco «minería de datos» para traducir este concepto,
es, and consequent protein amino acid sequences, that are pero el gerundio mining del verbo to mine no tiene nada
known from sequencing of genomes and cDNA libraries» que ver con la minería en este caso. Más relación guarda
(esta definición es algo antigua; se basa en un artículo de con la acepción 2.b que recoge el diccionario
MerriamAndrade y Sander publicado en 1997, y el glosario no in- Webster: «2.b: to extract from a source <information
cluye computational biology como entrada separada). mined from the files>». En cambio, nuestra «minería»
Por último, en el tesauro de la Biblioteca Nacional de tiene estos significados: «1. f. Arte de laborear las minas.
Medicina de los Estados Unidos (MeSH, Medical Subject | 2. f. Conjunto de los individuos que se dedican a este
Headings), elaborado en colaboración con especialistas trabajo. | 3. f. Conjunto de los facultativos que
entiende las esferas respectivas, la expresión computational bio- den en cuanto concierne a ese trabajo. | 4. f. Conjunto
logy figura como sinónimo estricto de bioinformatics, con de las minas y explotaciones mineras de una nación o
la siguiente definición: «A field of biology concerned with comarca».
the development of techniques for the collection and ma- dihemic: dihémica.
nipulation of biological data, and the use of such data to Calificativo que se aplica a cualquier proteína constituida
make biological discoveries or predictions. This field en- por dos grupos hemo. En el caso del citocromo c-550,
compasses all computational methods and theories appli- también conocido como citocromo c-549, la proteína está
cable to Molecular Biology and areas of computer-based formada por dos subunidades polipeptídicas y cada
subtechniques for solving biological problems including ma- unidad tiene su correspondiente grupo hemo (como grupo
nipulation of models and datasets». prostético). Véase heme.
blueprint: juego completo de genes (genoma), material he- DNA array: matriz de ADN.
reditario (ADN o ARN), información genética (contenida Distribución ordenada de cientos a miles de moléculas de
en la secuencia nucleotídica del genoma), constitución ADN de secuencia conocida —las sondas o probes— sobre
genética (genotipo), según el contexto. un soporte sólido. Estas sondas se hibridan con una
solu→ genetic blueprint ción de ácidos nucleicos desconocidos —las dianas o
tarchip: chip. gets— que han sido marcados de antemano mediante algún
1 Matriz. Véanse array y DNA array. procedimiento específico. Tras la hibridación y los lavados
2 Circuito integrado que cumple numerosas funciones en correspondientes, los híbridos retenidos en la matriz emiten
ordenadores y otros dispositivos electrónicos. una señal que puede de ser interpretada por instrumentos
comprehensive biology: biología de sistemas. adaptados al tipo de señal en cuestión (por ejemplo,
me→ systems biology diante microscopia confocal de barrido láser). Se obtiene
computational biologist: bioinformático. así una imagen característica (véase la figura 1).
→ bioinformatics Observación: las sondas se pueden sintetizar
directacomputational biology: bioinformática. mente sobre una superficie rígida de vidrio (p. ej., en el
→ tics caso de los oligonucleótidos) o se pueden preparar con
anCpG island: isla de CpG. terioridad (p. ej.: oligonucleótidos, ADNc clonados,
proObservación: a veces figura con la grafía CG island. ductos de PCR, etiquetas de secuencia expresada [EST],
En este caso se omite la letra pe (p) que representa el grupo un fragmento génico), y en ese caso se ligan
posteriorfosforilo de unión entre el 3’-OH de la desoxicitidina y el mente al soporte de vidrio o a una membrana de nailon.
5’-OH de la desoxiguanosina. En castellano también cir- Las dianas son, por lo general, ADNc obtenidos por
transcula la opción «islote de CpG», pero su equivalente inglés cripción inversa a partir de ARNm o ARN total. La matriz
(CpG islet) apenas se utiliza en comparación con CpG is- de nailon no se presta a miniaturización extrema debido
land. Véase domain. a la naturaleza porosa de la membrana (por eso también
data mining: prospección de datos. se conoce con el nombre de macromatriz o macroarray,
Descubrimiento de relaciones o pautas existentes dentro para diferenciarla de la que puede tener un tamaño más
de un grupo de datos experimentales mediante el uso de pequeño, conocida como micromatriz o microarray,
nortécnicas analíticas semiautomatizadas o completamente malmente de vidrio), pero puede servir para estudiar las
automatizadas, y la consiguiente formulación de hipóte- pautas de expresión génica de organismos con genomas
sis. relativamente pequeños, como las bacterias, y es muy
Observación: es sinónimo de pattern analysis, intel- popular en los laboratorios, pues la determinación de las
ligent data analysis, knowledge discovery, pattern dis- pautas de expresión génica mediante estas matrices se
covery y pattern recognition. Por «pauta» (pattern) se basa en protocolos convencionales de transferencia e
hientiende en este caso cualquier relación que pueda existir bridación de tipo Southern, muy familiares para el biólogo
dentro de un conjunto específico de datos. Según Hiroaki molecular. En cambio, las micromatrices no admiten estos
Kitano (2002), constituye una de las dos ramas de la bio- protocolos de hibridación.
o266 Panace . Vol. VI, n. 21-22. Septiembre-diciembre, 2005@<www.medtrad.org/panacea.html> Traducción y terminología
Las matrices de ADN permiten comparar la pauta → DNA array
de expresión génica (gene expression profiling) de dos Matriz de ADN sobre un soporte de vidrio que,
depoblaciones celulares distintas partiendo de muestras de bido a su tamaño pequeño o a la extrema densidad de
ARNm o de ARN total, y también se usan con otros fines, muestras (puede contener miles de muestras de menos
2por ejemplo, en el diagnóstico de enfermedades, el estu- de 200 μm de diámetro por cm de soporte matricial),
dio de polimorfismos y el desarrollo de fármacos. El tra- normalmente no admite la utilización de dianas
radiductor debe estar atento, pues las palabras probe y target activas, sino que se utiliza con dianas fluorescentes.
se utilizan a veces de forma intercambiable y no con el expression array: matriz de expresión.
significado que hemos recogido aquí (el más difundido). Matriz de ADN que sirve para determinar la expresión de
Es sinónimo de biochip, DNA chip, gene chip y gene array una serie de genes simultáneamente. Las sondas (probes),
(y variantes de los mismos). Véase array. en este caso, son moléculas de ADNc o pequeños
fragmentos de ADNc (conocidos con el nombre de «etiquetas
de secuencia expresada» o EST), o fragmentos génicos
Figura 1: Esquema de un experimento de hibridación en inmovilizados sobre un soporte sólido, y las dianas
(tarmicromatriz de ADN gets) consisten en ADNc obtenidos por transcripción
inversa a partir de una muestra de ARN (usualmente
ARNm), procedentes de un determinado tejido y
marcados por medio de algún procedimiento específico.
Observación: es sinónimo de RNA chip y RNA
biochip. Véase DNA array y EST.
gene array: matriz génica.
→ DNA array
gene chip:
→ DNA array
Observación: existen matrices de ADN de Affymetrix
®que llevan por nombre comercial GeneChip .
genetic blueprint: juego completo de genes (genoma),
material hereditario (ADN o ARN), información genética
(contenida en la secuencia nucleotídica del genoma),
conSe obtienen sondas complementarias de los genes de interés, se stitución genética (genotipo), según el contexto.
amplifican por PCR, se purifican y se siembran en un portaobje- La expresión genetic blueprint (o su forma abreviada
tos de vidrio con ayuda de un robot. El ARN total extraído de las blueprint) evoca de inmediato en el lector entendido
muestras de estudio o de referencia se convierte en ADNc fluores- la noción de genotipo (la constitución genética de una
cente mediante una reacción catalizada por la transcriptasa inversa persona: «a detailed plan or program of action»). Sin
en presencia de fluoróforos específicos (conjugados Cy3−dUTP o embargo, en la práctica, se utiliza como sinónimo de
Cy5−dUTP). Las dianas fluorescentes se juntan y luego se hibri- al menos cuatro conceptos claramente diferenciables,
dan en condiciones rigurosas con las sondas de la matriz. Tras los aunque estrechamente emparentados entre sí, como
lavados respectivos, los híbridos retenidos en la matriz producen demuestra la siguiente búsqueda en archivos de Nature
una emisión característica al ser excitados por un rayo láser, y cada Genetics:
emisión es valorada de forma independiente por me- 1 Precedida de adjetivos como entire o complete,
normaldio de un microscopio confocal de barrido láser. Luego, un progra- mente se refiere al juego completo de genes de un
orgama informático se encarga de normalizar e integrar los resultados nismo (es decir, al genoma):
en una misma imagen coloreada, resaltando los niveles de
expresión superiores o inferiores al de la muestra de referencia. (Imagen Hardly a month goes by without the publication of the
procedente de: Duggan DJ, Bittner M, Chen Y, Meltzer P, Trent entire genetic blueprint —the genome— of some
JM. Expression profiling using cDNA microarrays. Nat Genet organism or other. In almost all cases, the organisms
1999; 21:10-14. Reproducida con permiso de Nature Publishing concerned are simple [...].
Group, <http://www.nature.com/>.)
The genome, representing the complete blueprint of
DNA chip: matriz de ADN. the organism, is the natural bounded system in which
→ DNA array to conduct this [...].
DNA macroarray: macromatriz de ADN.
→ DNA array Véase genome.
Matriz de ADN sobre una membrana de nailon que, por 2 Material hereditario o genético, molécula portadora de
su naturaleza porosa, no admite miniaturización y suele información genética, metafóricamente «hilo de la vida»
utilizarse con dianas radiactivas. (es decir, el ADN o el ARN, según cuál de los dos
comDNA microarray: micromatriz de ADN. ponga el genoma del organismo en cuestión):
oPanace . Vol. VI, n. 21-22. Septiembre-diciembre, 2005 267@Traducción y terminología <www.medtrad.org/panacea.html>
DNA is the genetic blueprint and it is synonymous finalización del mensaje genético. El código es el mismo
with life. para casi todos los organismos vivos y por eso se
considera universal, pero existen excepciones a la regla (por
Although RNA is generally thought to be a passive ejemplo, en la especie Mycoplasma capricolum, el codón
genetic blueprint, some RNA molecules, called UGA no es un codón de terminación, sino que codifica el
ribozymes, have intrinsic enzyme-like activity — aminoácido triptófano). En 1968, Robert W. Holley, Har
they can catalyse. Gobind Khorana y Marshall W. Nirenberg recibieron el
Premio Nobel de Medicina y Fisiología por su
interpretaVéase DNA y RNA. ción del código genético y la función que éste desempeña
3 Información genética (contenida en la secuencia nucleo- en la síntesis de proteínas.
tídica del genoma): genotype, to: genotipar, genotipificar.
Caracterizar y analizar el genotipo (la constitución
genéThe ultimate goal of the human genome project is tica) de un organismo, en uno o más locus y por medios
to analyse the genetic blueprint of our genome diversos (genéticos, moleculares, inmunológicos, etc.),
and elucidate the mechanism of control of gene utilizando células, tejidos u organismos enteros.
expression [...]. Observación: en castellano no existe el verbo tipar,
pero sí tipificar, que la vigésima segunda edición del
dic[...] as this discovery was a big leap then, the next cionario académico de la lengua española (DRAE 2001)
step today is to discern the parasite’s blueprint; the registra con tres acepciones de uso distintas, una de las
genomic sequence of Plasmodium falciparum. cuales, la que más se aproxima a la idea de
caracterización, es la segunda: «dicho de una persona o de una cosa:
Véase sequence. Representar el tipo de la especie o clase a que pertenece»
4 Constitución genética de un individuo (es decir, su ge- (en el sentido de que una persona o una cosa caracteriza o
notipo): representa el tipo de la clase a la que pertenece). Si bien el
verbo genotipificar no se utiliza en ese sentido, no resulta
[...] characteristics of an organism, which result from difícil imaginar cómo se ha popularizado en la práctica
the interaction of the organism’s genetic ‘blueprint’ con el significado que aquí se indica (caracterización del
(its genotype) and the environment. genotipo).
genotyping: genotipado, genotipificación.
Véase genotype. Acción y efecto de genotipar o genotipificar.
genetic code: código genético. → genotype, to
Clave que permite pasar de un lenguaje de cuatro letras Observación: en castellano, es muchísimo más
fre(las bases nucleotídicas) a otro de 20 aminoácidos (número cuente «genotipado» que «genotipificación». Por lo
code aminoácidos naturales conocidos que componen las mún, el genotipado se basa en el análisis de polimorfismos
proteínas de los seres vivos). (variaciones genéticas) presentes en una muestra de ADN
Observación: el código genético está organizado en (polimorfismos de la longitud de fragmentos de restricción
grupos de tres nucleótidos; cada grupo de tres nucleótidos o RFLP, microsatélites o minisatélites, polimorfismos de
se llama triplete o codón, y cada triplete o codón represen- un solo nucleótido o SNP), pero el término tiene un
signita un aminoácido. Un gen incluye una serie de codones que ficado más amplio, al aplicarse asimismo a cualquier
pruese leen consecutivamente a partir de un punto de partida, ba que permita revelar los alelos de locus específicos de
el codón de iniciación (AUG o GUG), hasta otro de fina- un individuo (como en la determinación de los genotipos
lización, el codón de terminación (UAG, UGA y UAA). AO y AA, asociados al grupo sanguíneo A).
Los tripletes no son superponibles (cada codón consiste haem: hemo.
en tres nucleótidos, y el codón inmediatamente posterior → heme
está constituido por los tres nucleótidos siguientes), prue- hammerhead ribozyme: ribozima «cabeza de martillo»,
riboba de ello es que una mutación génica capaz de alterar un zima en cabeza de martillo.
único nucleótido solo puede cambiar un aminoácido del Pequeña ribozima capaz de hidrolizar enlaces fosfodiéster
polipéptido codificado por dicho gen. Se pueden formar propios, cuya estructura secundaria recuerda la forma de la
64 tripletes o codones diferentes a partir de los cuatro nu- cabeza de un martillo (de allí su nombre: hammerhead). Está
cleótidos básicos que componen un ácido nucleico, y 61 presente, como motivo de ARN, en viroides como el PLMVd,
de ellos codifican los 20 aminoácidos naturales, lo cual en ARN satélites o virusoides, en ARN de virus de plantas y
quiere decir que un mismo aminoácido puede estar codifi- animales y en algunos ARNm. Véanse motif y ribozyme.
cado por más de un triplete (por eso se dice que el código heme: hemo; derivado hémico.
es redundante, en inglés degenerate). Los tripletes equiva- 1 Hemo (heme). Forma abreviada de ferrohemo
(ferrohelentes se conocen como synonym codons y suelen diferir me, ferrohaem) o protohemo (protoheme), nombre común
en un solo nucleótido (el tercero en dirección 5’→ 3’). Los de la ferroprotoporfirina (ferroprotoporphyrin), otrora
tres tripletes restantes (64 – 61 = 3) sirven para señalar la conocida como ferroprotoporfirina IX
(ferroprotoporo268 Panace . Vol. VI, n. 21-22. Septiembre-diciembre, 2005@<www.medtrad.org/panacea.html> Traducción y terminología
phyrin IX). Existe en forma libre o como grupo prostético ess for rapid assessment of the activity of samples from a
de hemoproteínas (heme proteins o hemoproteins), p. ej.: combinatorial library or other compound collection, often
hemoglobinas, eritrocruorinas, mioglobinas, algunas pe- by running parallel assays in plates of 96 or more wells»
roxidasas, catalasas y citocromos. [IUPAC]). No obstante, no son exactamente equivalentes
2 Derivado hémico (heme o heme derivative). En esta se- los conceptos de gran productividad y rapidez, aunque
esgunda acepción, heme es nombre genérico, sinónimo de tán estrechamente vinculados entre sí («to obtain rapid,
heme derivative. Como genérico designa cual- high throughput genotyping of the angiotensin converting
quier complejo de coordinación formado por un ión de enzyme gene intron [...]», «the human genome project is
hierro (átomo central), una porfirina (ligando tetradentado) driving the development of high-speed and
high-throughy uno o más ligandos axiales que ocupan la quinta y sexta put DNA sequencing and analysis methods.»). Otras
veposición de coordinación y difieren según el compuesto ces, por high-throughput se entiende más específicamente
de que se trate, con independencia del estado de oxida- la capacidad de analizar un gran número de muestras en
ción del átomo de hierro (ferroso +2 o férrico +3). La mio- paralelo en un solo experimento, como sucede en las
maglobina (y cualquiera de las hemoproteínas mencionadas trices de ADN («Another important high-throughput
geanteriormente) es un ejemplo de derivado hémico, donde nomic tool is the DNA or oligonucleotide array»). Véanse
un aminoácido de la proteína (la histidina) y una molé- throughput y ultra high-throughput.
cula de oxígeno ocupan la quinta y sexta posiciones de in silico: in silicio.
coordinación, respectivamente. Otro ejemplo es la hemina Locución adverbial muy utilizada en biología molecular
(hemin), el cloruro del hemo. Por ser los derivados hémi- para calificar simulaciones, modelos, experimentos o
análicos un grupo específico de porfirinas (pigmentos natura- sis realizados en la computadora o el ordenador. P. ej.: «[...]
les que tienen un anillo tetrapirrólico en común) también This also witnessed the establishment of a new facet of the
se conocen popularmente con el nombre de «porfirinas» study of life, added to its study in vivo and in vitro: the
o, más específicamente, de «ferroporfirinas», pero nunca study of living organisms with computers, in silico».
como «hemos». Observación: los archivos de HighWire Press y Nature
Observación: en castellano, la palabra «hemo» (sing.) registran su uso desde 1996, a veces como sinónimo de in
se refiere siempre al grupo prostético hemo (primera machina y virtual. En los archivos de Science su aparición
acepción). Como nombre genérico, heme (heme deriva- es posterior a 1999. Según Fernando Navarro, la locución
tive) nunca debe traducirse por «hemoderivado», especial- latina correcta debe ser in silicio (como raramente se
esmente en textos medicobiológicos, dado que en medicina cribe) y no in silico, dado que el nombre latino del silicio
tiene un significado distinto al aplicarse a cualquier deri- no es silicum, sino silicium. Como adjetivo calificativo
vado de la sangre (p. ej.: concentrado de inmunoglobuli- puede traducirse por «ficticio», «virtual», «aparente»,
nas, albúmina humana, de fibrinógeno, fac- «por ordenador» o «producido en el ordenador», en
opotores de coagulación). Véase hemo-. sición a «real»: «these in silico polymorphisms still need
heme derivatives: derivados hémicos. to be validated».
→ heme (2.ª acepc.) integrated biology: biología de sistemas.
hemes: derivados hémicos. → systems biology
→ heme (2.ª acepc.) integrative biology: biología de sistemas.
hemo-: hemo- →
1 Prefijo que expresa relación con la sangre. intelligent data analysis: prospección de datos.
2 Prefijo que expresa relación con un grupo hemo. Véase → data mining
heme. intron-specific splicing factor: factor de corte y empalme
Observación: el Oxford Dictionary of Biochemistry codificado por intrón.
and Molecular Biology también recoge las formas hema- → maturase
y hem- y, en inglés británico, haemo-, haema- y haem-, isoschizomer: isoesquizómero.
además de hemato- (o haemato-). En castellano adopta Endonucleasa de restricción que reconoce la misma
seasimismo las variantes hemato-, hema- y hemat-. cuencia de nucleótidos que otra enzima de restricción,
high-throughput: adj. de gran productividad, rápido. con idéntica especificidad. Por extensión, el término
tamCalificativo aplicado a cualquier técnica automatizada que bién se aplica a las enzimas de restricción que escinden
permite obtener un gran número de resultados o efectuar el ADN en distintos sitios dentro de la misma secuencia
un gran número de procesos por unidad de tiempo. de reconocimiento.
Observación: los métodos o técnicas high-through- knowledge discovery: prospección de datos.
put, debido a su gran productividad, se definen muchas → data mining
veces como técnicas rápidas, por ejemplo: high-through- loss-of-function mutation: mutación amórfica, mutación
anuput sequencing («a fast method of determining the order of ladora.
bases in DNA»), high throughput structure determination → null mutation
(«the process of rapidly generating protein structures from maturase: factor de maduración (del preARNm), factor de
genetic information»), high-throughput screening («proc- corte y empalme codificado por intrón.
oPanace . Vol. VI, n. 21-22. Septiembre-diciembre, 2005 269@Traducción y terminología <www.medtrad.org/panacea.html>
Proteína codificada por intrones de los grupos I o II. Se une firiendo, pese a todo, el calco «madurasa», por su
brevea su intrón codificante e induce el cambio de conformación dad y tradición, especialmente llegado el caso de que la
necesario para que el intrón se escinda del preARNm re- proteína figure con el único nombre de maturase en la
spectivo y éste continúe su proceso de maduración —em- base de datos correspondiente.
palme de exones, poliadenilación y adquisición de la se- microchip: microchip.
cuencia protectora de guanilatos en el extremo 5’— hasta → chip
convertirse en el ARNm correspondiente. multidisciplinary biology: biología de sistemas.
Observación: el NC-IUBMB, en su introducción a → systems biology
la Classification and Nomenclature of Enzymes by the mutase: mutasa.
Reactions they Catalyse, desaconseja vivamente el uso Cualquier enzima de la clase de las isomerasas que
catalidel sufijo -ase para formar nombres de proteínas car- za el traslado intramolecular de un grupo químico.
entes de la actividad catalítica que su nombre supues- Observación: no se trata de una proteína con
activitamente indica: «The first general principle of these dad mutágena. Las isomerasas son enzimas de la Clase EC
‘Recommendations’ is that names purporting to be names 5 en la nomenclatura enzimática del NC-IUBMB.
of enzymes, especially those ending in -ase, should be network biology: biología de sistemas.
used only for single enzymes, i.e. single catalytic enti- → systems biology
ties. [...] In this context it is appropriate to express disap- new biology:
proval of a loose and misleading practice that is found →
in the biological literature. It consists in designation of null allele: alelo nulo, alelo amorfo.
a natural substance (or even of an hypothetical active Alelo completamente inactivo o ausente como resultado
principle), responsible for a physiological or biophysical de una mutación.
phenomenon that cannot be described in terms of a defi- Observación: en todos los casos se pierde por
complenite chemical reaction, by the name of the phenomenon to la función asociada al alelo. Por lo tanto, un alelo nulo o
in conjugation with the suffix -ase, which implies an in- amorfo se comporta en la práctica como un alelo recesivo
dividual enzyme. Some examples of such phenomenase (recessive) o «silencioso» (silent) —llamado así porque
nomenclature, which should be discouraged even if there no se «expresa», es decir, no se traduce en un producto
are reasons to suppose that the particular agent may have activo— y no influye en absoluto en el fenotipo general
enzymic properties, are: permease, translocase, reparase, del individuo portador. Veáse null mutation.
joinase, replicase, codase, etc.». null mutation: mutación anuladora, mutación amórfica.
La situación de esta proteína es bastante peculiar; Mutación de un alelo que redunda en la pérdida completa
por un lado, tiene un dominio con actividad de endonu- de su función, ya sea porque no se transcribe ni se
tracleasa y, en el caso de los intrones del grupo II, otro con duce o porque sintetiza un producto carente de actividad
actividad de transcriptasa inversa (el sufijo -ase en estos biológica.
casos está bien aplicado, puesto que se trata de actividades Observación: no se trata de una mutación completa,
enzimáticas), pero el dominio al que se le atribuye la ac- sino de la pérdida completa de la función del alelo
afectatividad maturase carece de tal actividad (puesto que no do, que es muy distinto: una mutación puede ser completa,
convierte el preARNm en ARNm). Por ejemplo, una de entendiéndose por ello la transformación completa de un
las maturases mejor estudiadas es la proteína LtrA de L. alelo A en otro A y, sin embargo, no redundar en un ale-1 2
lactis, cuyo nombre oficial completo es en realidad group lo amorfo. Tampoco puede decirse que sea nula (falta de
II intron-encoded protein ltrA y no maturase (<www. fuerza, ninguna), sino todo lo contrario: su efecto es la
expasy.org/uniprot/P0A3U0>). Se trata de una proteína anulación completa de la función asociada al gen
afectamultifuncional; en la base de datos Swiss-Prot (<www.ex- do. Por otro lado, el lector debe tener presente que la
palapasy.org>) figura con las dos actividades de endonucleasa bra mutation designa a veces al individuo portador de una
y transcriptasa inversa y con una tercera actividad (RNA- mutación, es decir, al mutante mismo y no a la mutación
maturase activity), que en realidad corresponde a la de las propiamente dicha. Véase mutation.
enzimas de la clase EC 3.1 del NC-IUBMB (hidrolasas de omics: ómicas.
enlaces éster). Forma abreviada de referirse coloquialmente a diversas
Por consiguiente, la designación maturase (formada esferas emergentes de la biología molecular dedicadas
con el nombre de un fenómeno, la maduración del pre- al estudio de todos los componentes de una determinada
ARNm, más el sufijo -ase) contraviene de forma fla- clase dentro de un sistema biológico dado, con ayuda de
grante las normas del NC-IUBMB (de hecho, no hay herramientas automatizadas de análisis a gran escala. Por
ninguna enzima que se llame maturase en la clasificación ejemplo: genomics (genómica, estudio cuantitativo de la
enzimática de este comité). totalidad de genes y secuencias reguladoras y no
codifiUn significado muchísimo más claro trasmite un sinó- cantes contenidas en el genoma), transcriptomics
(transnimo de maturase que es intron-specific splicing factor criptómica, estudio de la población total de ARN
trans(factor de corte y empalme codificado por intrón), aunque critos), proteomics (proteinómica o proteómica, estudio de
está claro que, luego, en la práctica, habrá quien siga pre- todas las proteínas sintetizadas y de sus posibles
modificao270 Panace . Vol. VI, n. 21-22. Septiembre-diciembre, 2005@<www.medtrad.org/panacea.html> Traducción y terminología
ciones postraduccionales), metabolomics (metabolómica, pathway biology: biología de sistemas.
estudio del complemento de metabolitos de bajo peso mo- → systems biology
lecular), glycomics (glucómica, estudio de todos los hidra- pattern analysis: prospección de datos.
tos de carbono), pharmacogenomics (farmacogenómica, → data mining
estudio cuantitativo de la forma en que el genotipo afecta pattern discovery:
a la respuesta del individuo a un determinado fármaco). → data mining
(La lista anterior no es exhaustiva.) pattern recognition: prospección de datos.
Observación: según Günter Kahl (catedrático de → data mining
Plant Molecular Biology en la Universidad Johann Wolf- postgenomic biology: biología de sistemas.
gang Goethe, en Frankfurt [Alemania], y autor de The → systems biology
Dictionary of Gene Technology), el término fue acuñado protein array: matriz de proteínas.
por John N. Weinstein (Head, Genomics & Bioinformatics Distribución ordenada de miles de moléculas de proteína,
Group del National Cancer Institute, Bethesda, Maryland o de péptidos sintetizados in situ, sobre un soporte sólido.
[EE. UU.]). Observación: las matrices proteínicas difieren en la
pathway: vía; red o sistema. naturaleza del soporte físico y el protocolo de obtención
1 Vía. Serie lineal de reacciones químicas de la que es e inmovilización de moléculas, tal como ocurre con las
objeto una determinada entidad molecular o clase de enti- matrices de ADN. En proteómica y genómica funcional
dades moleculares dentro de un sistema. Por ejemplo, permiten analizar en paralelo miles de interacciones entre
cualquier vía metabólica (metabolic pathway) o serie de proteínas (p. ej.: antígenos con anticuerpos) o de proteínas
reacciones conectadas que tienen lugar en una célula u or- con ligandos específicos (enzimas con sustratos,
ganismo biológico: con fármacos, etc.). También se utilizan en pruebas
diagnósticas. Véase DNA array.
We have cloned and sequenced the dit gene cluster protein microarray: micromatriz de proteínas.
encoding enzymes of the catabolic pathway for → protein array
abietane diterpenoid degradation by Pseudomonas quantitative biology: biología de sistemas.
abietaniphila BKME-9. → systems biology
replisome: replisoma; complejo de replicación.
2 Red o sistema. Conjunto de interacciones o de relacio- Complejo formado por el conjunto de las proteínas
prenes funcionales entre componentes físicos o genéticos de sentes en la horquilla de replicación del ADN. No hay
conuna célula, que operan de forma concertada para llevar a senso en cuanto a su composición (pues parece depender
cabo un proceso biológico. de que el complejo no se disocie durante la purificación).
Entre sus componentes se han citado la primasa, la
ADNOne abstraction that biologists have found extremely helicasa, la proteína de unión a ADN monocatenario o
useful in their efforts to describe and understand the proteína SSB, la topoisomerasa y la ADN-polimerasa III
inner workings of cellular biology is the notion of (en E. coli). Existe únicamente como unidad asociada a la
a biomolecular network, often called a pathway. estructura peculiar que el ADN adopta en la horquilla de
A pathway is a set of interactions, or functional replicación, y no como unidad independiente (como en el
relationships, between the physical and/or genetic [2] caso del ribosoma).
components of the cell which operate in concert to Observación: el nombre se atribuye a Kornberg
carry out a biological process. (1974), quien lo utilizó por primera vez para designar el
complejo de proteínas responsable de la replicación del
A cell is built up of molecules, as a house is with stones. ADN en E. coli. Para Günter Kahl es sinónimo de
priBut a soup of molecules is no more a cell Than a heap mosome o primosome complex y excluye la
ADN-polimeof stones is a house. To support an understanding rasa. Véase primosome.
of the functioning and function of cells, in our view RNA biochip: matriz de expresión.
systems biology ought to focus on mathematical → expression array
modelling and simulation of the dynamics associated RNA chip:
with biochemical reaction networks (pathways). → y
simulation-based analysis: análisis basado en simulaciones.
Observación: la segunda acepción, la más nueva Prueba de hipótesis basada en experimentos ficticios
y popular en biología de sistemas, hace hincapié en el realizados en la computadora o el ordenador (es decir,
carácter interactivo de los componentes de un pathway in silicio) con miras a formular predicciones que luego
biológico, tal como ocurre, por ejemplo, en los signal- puedan comprobarse en estudios realizados in vitro o in
ing pathways (sistemas de transducción de señales): «Sig- vivo.
naling events within or between cells are not restricted to Observación: según Hiroaki Kitano, constituye una de
linear pathways, but are well-known to be complex and las dos ramas de la bioinformática; la otra es la
prospecdynamic networks». ción de datos (data mining). Véase data mining.
oPanace . Vol. VI, n. 21-22. Septiembre-diciembre, 2005 271@Traducción y terminología <www.medtrad.org/panacea.html>
system: sistema. entre 2001 y 2002 por dos autoridades en la materia: el
1 Biol. y med. Conjunto de órganos que intervienen en al- presidente y director del Institute for Systems Biology
guna función vegetativa (p. ej.: sistema nervioso, sistema (Seattle [EE. UU.]), Leroy Hood, muy citado en la
liteinmunitario, sistema digestivo). ratura específica como uno de los primeros en abordar el
2 Biol. de sistemas. Grupo de partes o de elementos bio- estudio de dos sistemas biológicos desde la perspectiva
lógicos interconectados, interactuantes e interdependien- que ofrece la biología de sistemas, y Hiroaki Kitano, autor
tes que conforman una unidad coherente con propiedades del libro Foundations of Systems Biology.
intrínsecas nuevas (emergent properties), resultantes de la Desde entonces se han propuesto definiciones más
interacción de los elementos que lo componen y no de la sucintas (2005), por ejemplo: «Systems Biology can
simple suma de sus partes. Presenta gran estabilidad feno- mostly simply be defined as the search for the syntax of
típica (robustness) frente a determinadas perturbaciones biological information, that is, the study of the dynamic
internas y externas debido a: 1) la existencia de mecanis- networks of interacting biological elements.» (R.
Aemos de regulación; 2) su estructura modular (modularity) bersold, Institute for Molecular Systems Biology, Zúrich
o, lo que es lo mismo, la existencia de subunidades fun- [Suiza]), o: «Systems Biology integrates experimental
cionales o de subsistemas más sencillos (modules) dentro and modeling approaches to explain the structure and
del sistema, que pueden estudiarse de forma independiente dynamical properties of biological systems as networks
(p. ej.: los orgánulos forman células que son las unidades of its molecular components.» (comunicación electrónica
constituyentes de los tejidos, y éstos de los órganos, y éstos de Eduardo R. Mendoza, LMU Physics Department and
de los organismos, y éstos a su vez de una población); 3) Center for NanoScience, Múnich [Alemania]). Por último,
la multiplicidad de módulos o subsistemas que cumplen la este nuevo enfoque del estudio de la biología ha recibido por
misma función (redundancy) de suerte que su eliminación parte de los especialistas muchísimas otras denominaciones,
o deterioro no afecta al resto de las partes; 4) su estabilidad a saber: integrative biology, integrated biology, pathway
estructural (structural stability), con independencia de que biology, network biology, new big biology o new biology,
tenga una estructura física concreta. Así, la utilización de comprehensive biology, postgenomic biology, quantitative
glucosa en las levaduras, la fijación simbiótica de nitrógeno biology, mathematical modeling of biological processes,
o la quimiotaxia bacteriana, al igual que un orgánulo, un multidisciplinary biology, molecular physiology (que no es
tipo celular, un tejido, un órgano, un organismo o una po- sinónimo estricto de biología de sistemas) y the convergence
blación constituyen ejemplos de sistemas biológicos. of biology and computer science.
systems biology: biología de sistemas. throughput: productividad.
Estudio de la totalidad de elementos que componen un sis- Capacidad de producción (número de resultados
obtenitema biológico y de sus interrelaciones en respuesta a per- dos o de procesos realizados) por unidad de tiempo. Por
turbaciones biológicas, genéticas o químicas realizadas de ejemplo:
forma sistemática, con objeto de predecir con la mayor
exactitud posible el comportamiento de dicho sistema ante In 1986, we developed the first automated DNA
una determinada perturbación mediante herramientas in- sequencer (Smith et al., 1986). From that time until
formáticas que ayuden a interpretar los datos obtenidos, today, there has been approximately a 2000-fold
crear modelos y efectuar simulaciones. increase in throughput of DNA sequencing (today’s
Observación: la biología de sistemas es el resultado instruments may sequence about 1.5 million base
de la aplicación de la teoría de a la biología, pero pairs per day). My prediction is that over the next
esta idea no es nueva, sino que data al menos de la década 7-10 years, the development of single molecule DNA
de 1940, época de la cibernética de Norbert Wiener, en sequencing will increase the rate of sequencing by
que la biología molecular se encontraba aún en pañales. another 2000 - 4000 fold. [Secuenciación automática
La razón principal de su renovado interés hoy día es que el de ADN.]
progreso realizado en biología molecular, especialmente
tras la secuenciación del genoma humano y de otros geno- With automation, high throughput is possible. At
mas y la disponibilidad de herramientas de análisis a gran present, we can process 1200 ligation reactions per
escala informatizadas y automatizadas, permite ahora day with a single operator and robotic workstation,
contar con una gran cantidad de datos experimentales and, in the near future, further automation with a
acerca de la estructura y función de los componentes esen- robotic arm will permit processing of 600 reactions
ciales de los organismos vivos (genes, proteínas, ARN, per day. [Detección de secuencias específicas de ADN
etc.) e integrarlos en modelos matemáticos que ayuden a por PCR y discriminación alélica mediante ligado de
comprender las propiedades estructurales y dinámicas de oligonucleótidos.]
los sistemas biológicos de los que forman parte.
En la actualidad (2005), todavía no hay consenso so- The method has a high throughput rate, one technician
bre lo que es la biología de sistemas, y su definición de- can assay 200 samples in duplicate in a working
pende en gran medida de la experiencia del investigador. week. [Método de radioinmunoanálisis específico
paLa que recogemos aquí se basa en artículos publicados ra detectar clomipramina.]
o272 Panace . Vol. VI, n. 21-22. Septiembre-diciembre, 2005@<www.medtrad.org/panacea.html> Traducción y terminología
Observación: en la Argentina se conoce asimismo (UHTS)». Así pues, al menos en el ámbito de la química
como «procesividad». combinatoria, sólo a partir de una velocidad de cribado
tissue array: matriz de tejidos. equivalente a 100 000 ensayos por día se considera
ul→ tissue microarray trarrápido el proceso.
tissue microarray: micromatriz de tejidos.
Distribución ordenada de cientos de muestras de tejido Agradecimientos
cilíndricas y minúsculas en un bloque de parafina (uno Agradezco a los doctores Eduardo R. Mendoza, Fernando
de los formatos preferidos es el de 400 muestras hísticas Navarro y Horacio E. Hopp, y, muy especialmente, a Diego
de 0,6 mm de diámetro por bloque). Luego, se cortan González-Halphen, Laura Munoa y Gonzalo Claros los
secciones del bloque de parafina con un microtomo espe- comentarios y sugerencias recibidos en relación con los
cial y cada sección se coloca sobre un portaobjetos y se temas que aquí se abordan. Sus pertinentes observaciones
somete a una técnica de análisis específica. El resultado han permitido mejorar sensiblemente el contenido de esta
se visualiza e interpreta al microscopio, normalmente séptima entrega del «Vocabulario de bioquímica y biología
con ayuda de aparatos y programas especiales. También molecular».
se pueden utilizar líneas celulares, en vez de muestras
de tejido.
Observación: la micromatriz de tejidos, además de Bibliografía
suponer un ahorro en la cantidad de muestra requerida A Glossary for Systems Biology. < http://sysbio.ist.uni-stuttgart.de/
para el análisis al microscopio mediante técnicas con- projects/glossary/Contents.shtml> [consulta 9.9.2005].
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2 (mucho menos frec.) Traslación. Movimiento o despla- WH Freeman and Company; 2002.
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un mismo «lenguaje», esto es, la secuencia de nucle- Cary MP, Bader GD, Sander C. Pathway information for systems
biolótidos. En la síntesis de ARN a partir de ADN la in- ogy, FEBS Lett 2005; 579: 1815-1820.
formación simplemente se copia o se transcribe de un Chitty M. Cambridge Health Institute: Sequencing glossary. <http://
ácido nucleico a otro (por ese motivo el proceso se lla- www.genomicglossaries.com/content/sequencing_gloss.asp>
[conma «transcripción»). En la síntesis de un polipéptido a sulta 27.7.2005].
partir de ARNm, en cambio, la información no se copia, Chitty M. Cambridge Healthcare Institute: Algorithms & data
managesino que se traduce a un «lenguaje» completamente dis- ment glossary .
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de polipéptidos o de proteínas (que están constituidas Chitty M. Cambridge Healthcare Institute: -Omes and -omics glossary.
por uno o más polipéptidos) recibe el nombre de «tra- <http://www.genomicglossaries.com/content/omes.asp> [consulta
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